Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy se jako národní poskytovatel ČR účastní programu EMPIR dlouhodobě a každoročně alokuje na spolufinancování mezinárodních projektů tohoto programu prostředky ve výši 1 milionu EUR. Podporou úspěšných projektů přispívá MŠMT ve spolupráci s ČMI k naplňování strategických cílů, které česká metrologie v mezinárodní spolupráci sleduje a které vyplývají z členství ČR v EU a v evropských metrologických orgánech a organizacích a z mezinárodních smluv a ujednání, jichž je ČR signatářem.
Program EMPIR je realizovaný na základě čl. 185 Smlouvy o fungování EU. Jeho koordinace probíhá v rámci asociace EURAMET (European Association of National Metrology Institutes), jejímž členem je ČMI od roku 1996. EURAMET sdružuje celkem 38 národních metrologických institutů. Hlavní nástroj jejich spolupráce představují právě projekty EMPIR, které se zabývají výzkumem, vývojem a inovacemi v oblasti metrologie a uplatňování jejich výsledků v široké škále aplikačních odvětví. Dvanáct projektů, které MŠMT v letech 2021 až 2024 podpoří, se zaměří na oblasti fundamentální metrologie, metrologie pro průmysl, na podporu sítí a dopadu, normativní projekty a na malé projekty spolupráce.
