Projekt EFIN je zaměřen na širokou škálu institucí: na vyšší odborné školy, vysoké školy dle zákona 111/1998 Sb. (veřejné, státní i soukromé) a také na veřejné výzkumné instituce, respektive na vědecko-výzkumné instituce, které splňují podmínky Rámce Společenství pro státní podporu výzkumu, vývoje a inovací.
Cílovou skupinou v rámci výše uvedených institucí jsou především ostatní pracovníci, kteří se zabývají řízením, vedením a správou podpůrných procesů těchto institucí (ekonomické procesy, administrace atd.). Jedná se o pracovníky na různých úrovních organizačního členění. U vysokých škol například jak na úrovni centrální (rektoráty), tak na úrovni fakult.
Se zástupci této cílové skupiny se bude v rámci realizace většiny klíčových aktivit velmi intenzivně pracovat - především se týká aktivit tvorba metodik, vzdělávací aktivity, realizace procesních analýz (auditů) či konferencí. Největší zapojení cílové skupiny je plánováno v rámci vzdělávacích aktivit. Celkově se počítá se zapojením nejméně 600 osob.
Nepřímou cílovou skupinou, která bude profitovat z realizace projektů, je celá skupina odborných pracovníků VOŠ, akademických pracovníků a studentů vysokých škol a vědecko-výzkumných pracovníků VaV institucí.