Mimořádný termín pro podání žádostí je upraven § 146 školského zákona.
Podle § 146 odst. 1 školského zákona platí: „Žádost o zápis školy nebo školského zařízení do rejstříku škol a školských zařízení pro následující školní rok se podává u krajského úřadu příslušného podle sídla právnické osoby, která bude vykonávat činnost školy nebo školského zařízení, do 30. září. V případě škol a školských zařízení, jejichž rejstřík vede ministerstvo, krajský úřad postoupí žádosti se svým vyjádřením ministerstvu do 30. listopadu.“
Podle § 146 odst. 2 školského zákona potom platí: „Orgán, který vede rejstřík škol a školských zařízení, může ve výjimečných případech hodných zvláštního zřetele prominout zmeškání termínu pro předložení žádosti uvedeného v odstavci 1 nebo rozhodnout o dřívější účinnosti zápisu školy nebo školského zařízení do rejstříku.“
Prominutí zmeškání termínu je vázáno na výjimečné případy hodné zvláštního zřetele. Záleží na posouzení konkrétní věci, zda důvod zmeškání zákonného termínu vyhodnotí ministerstvo jako výjimečný případ hodný zvláštního zřetele a zmeškání termínu pro předložení žádosti promine. Takovými případy mohou být zejména situace, kdy by nezapsání školy nebo školského zařízení (případně nezapsání změny údajů o škole nebo školském zařízení) do rejstříku škol a školských zařízení mohlo mít závažné negativní důsledky pro účastníky vzdělávání a dále pak situace, kdy účastník řízení nemohl z objektivních důvodů podat žádost v zákonném termínu.
Pokud ministerstvo zmeškání zákonem stanoveného termínu nepromine, nezabývá se více obsahem žádosti, nezkoumá, zda žádost splňuje všechny zákonem stanovené náležitosti, neopatřuje další podklady rozhodnutí a žádost zamítne podle § 148 odst. 2 školského zákona, dle něhož se žádost zamítne v případě, že nesplňuje náležitosti stanovené školským zákonem, a uvedené nedostatky nebyly ve stanovené přiměřené lhůtě odstraněny. Podání žádosti mimo termín stanovený v § 146 odst. 1 školského zákona přitom představuje neodstranitelný nedostatek žádosti.
