Ministerstvo spravuje celou řadu databází, za tím účelem rovněž pracuje s příslušnými klasifikačními kategoriemi.
Nejdůležitějším zdrojem dat z oblasti vysokého školství jsou SIMS – Sdružené informace matrik studentů. Evidují základní informace o vysokoškolském studiu každého studenta od r. 1999. Samotná databáze není veřejně přístupná, informace z ní jsou však pravidelně sbírány a zveřejňovány, a to formou souhrnných tabulek: Data o studentech, poprvé zapsaných a absolventech vysokých škol.
Ministerstvo vede Registr vysokých škol a uskutečňovaných studijních programů, jehož součástí je i Seznam poskytovatelů zahraničního vysokoškolského vzdělávání na území České republiky, uvedených v § 93a zákona č. 111/1998 Sb. o vysokých školách, a jimi uskutečňovaných zahraničních vysokoškolských studijních programů.
Ministerstvo rovněž shromažďuje výroční zprávy o činnosti vysokých škol. Souhrnné tabulky z těchto správ představují důležitý zdroj dat o činnosti VŠ.
Ministerstvo také sbírá data o docentech a profesorech působících na českých VŠ v Registru docentů a profesorů – REDOP.
Seznam akreditovaných studijních programů, včetně jejich kódů a platnosti akreditace, je k dispozici v Registru vysokých škol a uskutečňovaných studijních programů,
Postup při kódování studijních programů a přehled všech užívaných kódů, včetně příslušné metodologie, můžete nalézt zde: Kódy studijních programů a oborů.
Přehled číselníků používaných v rezortu školství je k dispozici v rámci webové aplikace zde.
Databáze regulovaných povolání v ČR (která však není zcela vyčerpávající), je k dispozici zde.
Národní statistické klasifikace užívané v rezortu školství naleznete zde.
