Zájem zapojení vysokých škol všech členských zemí o zapojení do programu CEEPUS, který letos slaví 20. výročí svého trvání, trvale narůstá. Zvyšuje se také zájem vysokých škol o čerpání stipendijních měsíců, které jsou členským zemím každoročně k dispozici. Týká se to i českých vysokých škol. Do programu CEEPUS je např. v akademickém roce 2014/2015 zapojeno 19 českých vysokých škol a 80 různých vysokoškolských pracovišť. Program CEEPUS přispívá k rozvoji spolupráce a vzájemných vztahů mezi sousedními zeměmi středoevropského regionu, podporuje evropský integrační proces, zapojení zemí jihovýchodní Evropy do evropského integračního procesu.
Česká republika předsedala programu CEEPUS již podruhé – poprvé to bylo v roce 1999. Současné předsednictví převzala na dva roky od Rakouska na 18. zasedání dne 4. dubna 2013.