Unie inovací klade důraz na zlepšení podmínek financování výzkumu, vývoje a inovací v EU s cílem zajistit, aby realizace inovativních myšlenek vedla k vytváření nových pracovních míst a produkci zboží a služeb zajišťujících trvale udržitelný růst ekonomiky EU. Jako hlavní překážky dynamického rozvoje inovací v EU byly identifikovány nedostatečné investice členských států do znalostní základny a vysoká míra roztříštěnosti podpůrných opatření, která neumožňuje koncentraci kritického množství kapacit. Unie inovací proto stanuje následující klíčové cíle:
- i v době fiskálních omezení musí EU a její členské státy nadále investovat do vzdělávání, výzkumu, vývoje a inovací tak, aby tyto investice byly nejen chráněny před rozpočtovými škrty, ale aby byly pokud možno i navyšovány;
- inovační systémy EU a jejích členských států musí být reformovány tak, aby došlo k jejich co nejvyšší míře provázanosti, odstranění roztříštěnosti a zajištění efektivity;
- vzdělávací systémy členských států EU musí být modernizovány na všech úrovních s důrazem kladeným na dosahování excelence a získání špičkových zahraničních studentů a odborníků;
- formování Evropského výzkumného prostoru musí být dokončeno do roku 2014 tak, aby byl zaručen volný pohyb znalostí v rámci EU;
- je nezbytné motivovat navýšení investic soukromého sektoru do inovačního systému, vytvořit a implementovat strategie inteligentní specializace (S3) a v souvislosti s tím plně využívat nástrojů kohezní politiky EU;
- spolupráce veřejného a soukromého sektoru musí být posílena za účelem efektivního transferu znalostí a uvádění nových nápadů na trh, důraz musí být kladen zejména na posílení inovačních kapacit malých a středních podniků.
Unie inovací předjímá, že reformy vzdělávacích, výzkumných a inovačních politik členských států EU doprovázené navýšením výdajů na výzkum, vývoj a inovace na cílovou hranici 3 % HDP EU do roku 2020 přispěje k vytvoření 3,7 milionu nových pracovních míst a zvýšení ročního HDP EU o téměř 800 miliard € do roku 2025.