Kancelář finančních mechanismů se domnívá, že subjekty s PIC kódem by měly být oprávněny žádat o 60 % paušál pro výpočet nepřímých nákladů, pokud je takový model uveden pro jejich PIC. Pokud tento subjekt (uchazeč a další účastník projektu) považuje 60% hranici u modelu kalkulace nepřímých nákladů za příliš vysokou, může použít nižší procentuální podíl výpočtu nepřímých nákladů (bez doložení metodikou).
MŠMT k danému uvádí, že instituce by při uvádění výše paušální částky pro výpočet nepřímých nákladů měla vystupovat konzistentně, v žádném případě nelze výši nepřímých nákladů stanovit vyšší paušální částkou, než která je pro danou instituci spojována s jejím PIC.